MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD06

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011889	GTG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011889	TCA	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011889	AC	3	6	149	154	50 %	0 %	0 %	50 %	220915102
4	NC_011889	ATCCT	2	10	259	268	20 %	40 %	0 %	40 %	220915102
5	NC_011889	GAT	2	6	294	299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
6	NC_011889	ATC	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
7	NC_011889	CTTAC	2	10	444	453	20 %	40 %	0 %	40 %	220915102
8	NC_011889	TGA	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
9	NC_011889	GGCC	2	8	526	533	0 %	0 %	50 %	50 %	220915102
10	NC_011889	AGA	3	9	599	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
11	NC_011889	AACG	2	8	623	630	50 %	0 %	25 %	25 %	220915102
12	NC_011889	T	6	6	699	704	0 %	100 %	0 %	0 %	220915102
13	NC_011889	AGG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
14	NC_011889	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
15	NC_011889	TGGG	2	8	809	816	0 %	25 %	75 %	0 %	220915102
16	NC_011889	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
17	NC_011889	AAT	3	9	927	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
18	NC_011889	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
19	NC_011889	ATG	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
20	NC_011889	ACG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
21	NC_011889	ATC	2	6	979	984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
22	NC_011889	GAG	2	6	993	998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
23	NC_011889	CCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
24	NC_011889	GGAA	2	8	1091	1098	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
25	NC_011889	TCTG	2	8	1145	1152	0 %	50 %	25 %	25 %	220915102
26	NC_011889	TCA	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
27	NC_011889	AG	3	6	1179	1184	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
28	NC_011889	CAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
29	NC_011889	AGATC	2	10	1192	1201	40 %	20 %	20 %	20 %	220915102
30	NC_011889	GA	4	8	1223	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
31	NC_011889	GA	4	8	1273	1280	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
32	NC_011889	GAAA	2	8	1356	1363	75 %	0 %	25 %	0 %	220915102
33	NC_011889	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220915102
34	NC_011889	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
35	NC_011889	TAA	2	6	1475	1480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
36	NC_011889	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
37	NC_011889	ACC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
38	NC_011889	AGA	2	6	1562	1567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
39	NC_011889	AAC	3	9	1571	1579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
40	NC_011889	CAG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
41	NC_011889	GGTC	2	8	1737	1744	0 %	25 %	50 %	25 %	220915102
42	NC_011889	CTA	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
43	NC_011889	TC	3	6	1831	1836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011889	CCG	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011889	CTT	2	6	1970	1975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011889	CGC	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011889	GCA	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011889	GGC	2	6	2065	2070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011889	ATG	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011889	GC	3	6	2101	2106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011889	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
52	NC_011889	CG	3	6	2134	2139	0 %	0 %	50 %	50 %	220915103
53	NC_011889	TGC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
54	NC_011889	TCC	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915103
55	NC_011889	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
56	NC_011889	TGA	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915103
57	NC_011889	CAC	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915103
58	NC_011889	GTCA	2	8	2646	2653	25 %	25 %	25 %	25 %	220915103
59	NC_011889	GCC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
60	NC_011889	GCG	2	6	2704	2709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915103
61	NC_011889	GGT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915103
62	NC_011889	GGCG	2	8	2766	2773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011889	ACGG	2	8	2833	2840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011889	CT	3	6	2851	2856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011889	ACGG	2	8	2883	2890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011889	GAAC	2	8	2897	2904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011889	ACC	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011889	CGGA	2	8	2977	2984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011889	TGC	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
70	NC_011889	GC	4	8	3051	3058	0 %	0 %	50 %	50 %	220915104
71	NC_011889	ACCC	2	8	3061	3068	25 %	0 %	0 %	75 %	220915104
72	NC_011889	GCT	2	6	3072	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
73	NC_011889	GCC	2	6	3108	3113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915104
74	NC_011889	CCGA	2	8	3117	3124	25 %	0 %	25 %	50 %	220915104
75	NC_011889	GCTCG	2	10	3135	3144	0 %	20 %	40 %	40 %	220915104
76	NC_011889	GAGC	2	8	3152	3159	25 %	0 %	50 %	25 %	220915104
77	NC_011889	GCTC	2	8	3166	3173	0 %	25 %	25 %	50 %	220915104
78	NC_011889	GGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915104
79	NC_011889	CAA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915104
80	NC_011889	GAA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915104
81	NC_011889	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
82	NC_011889	TGC	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
83	NC_011889	ATC	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915105
84	NC_011889	TCGG	2	8	3647	3654	0 %	25 %	50 %	25 %	220915105
85	NC_011889	CTG	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
86	NC_011889	GGT	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915105
87	NC_011889	C	6	6	3726	3731	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
88	NC_011889	TCG	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
89	NC_011889	CGG	2	6	3750	3755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
90	NC_011889	C	6	6	3858	3863	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
91	NC_011889	CGG	3	9	3882	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
92	NC_011889	C	6	6	3934	3939	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
93	NC_011889	GCC	2	6	4011	4016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915105
94	NC_011889	GGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011889	CGG	3	9	4090	4098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011889	CCGAC	2	10	4117	4126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_011889	C	7	7	4153	4159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_011889	CGTGG	2	10	4198	4207	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011889	GGC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011889	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011889	GTTC	2	8	4252	4259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011889	GGCG	2	8	4319	4326	0 %	0 %	75 %	25 %	220915106
103	NC_011889	GCCC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	25 %	75 %	220915106
104	NC_011889	ACCC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	0 %	75 %	220915106
105	NC_011889	GCGTC	2	10	4391	4400	0 %	20 %	40 %	40 %	220915106
106	NC_011889	CGGA	2	8	4440	4447	25 %	0 %	50 %	25 %	220915106
107	NC_011889	GAT	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
108	NC_011889	CTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915107
109	NC_011889	GCCT	2	8	4622	4629	0 %	25 %	25 %	50 %	220915107
110	NC_011889	GC	3	6	4673	4678	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
111	NC_011889	CGA	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
112	NC_011889	GCTT	2	8	4723	4730	0 %	50 %	25 %	25 %	220915107
113	NC_011889	GCT	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
114	NC_011889	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
115	NC_011889	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915107
116	NC_011889	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
117	NC_011889	CG	3	6	4885	4890	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
118	NC_011889	ATCCTC	2	12	4912	4923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220915107
119	NC_011889	AGC	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
120	NC_011889	ATG	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
121	NC_011889	GATA	2	8	4999	5006	50 %	25 %	25 %	0 %	220915107
122	NC_011889	GAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
123	NC_011889	CG	4	8	5121	5128	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
124	NC_011889	GCG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915107
125	NC_011889	GAC	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
126	NC_011889	GTG	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011889	A	6	6	5266	5271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011889	AAT	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011889	CAACC	2	10	5324	5333	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_011889	ATGG	2	8	5435	5442	25 %	25 %	50 %	0 %	220915108
131	NC_011889	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
132	NC_011889	GCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
133	NC_011889	CCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
134	NC_011889	GCG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
135	NC_011889	GCG	2	6	5790	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
136	NC_011889	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
137	NC_011889	GCA	2	6	5862	5867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
138	NC_011889	CGT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
139	NC_011889	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
140	NC_011889	ATC	2	6	5986	5991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
141	NC_011889	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
142	NC_011889	GGC	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
143	NC_011889	GCG	2	6	6038	6043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
144	NC_011889	CGG	3	9	6069	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
145	NC_011889	TGG	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
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147	NC_011889	GGT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
148	NC_011889	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
149	NC_011889	CAT	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
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151	NC_011889	CGCC	2	8	6402	6409	0 %	0 %	25 %	75 %	220915108
152	NC_011889	CAATGA	2	12	6432	6443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220915108
153	NC_011889	CGA	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
154	NC_011889	ATC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
155	NC_011889	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
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159	NC_011889	GACG	2	8	6802	6809	25 %	0 %	50 %	25 %	220915108
160	NC_011889	CAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
161	NC_011889	GCAGG	2	10	6982	6991	20 %	0 %	60 %	20 %	220915108
162	NC_011889	GCT	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
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164	NC_011889	GC	3	6	7214	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	220915108
165	NC_011889	AGC	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
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184	NC_011889	ATCGC	2	10	7988	7997	20 %	20 %	20 %	40 %	220915108
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200	NC_011889	GC	3	6	8550	8555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
201	NC_011889	GAG	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
202	NC_011889	CGT	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_011889	GCG	2	6	8629	8634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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225	NC_011889	CAA	2	6	9553	9558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_011889	CAA	2	6	9756	9761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_011889	A	6	6	9873	9878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_011889	CCA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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254	NC_011889	C	6	6	10972	10977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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256	NC_011889	TCC	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_011889	TCA	2	6	11094	11099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_011889	GAC	2	6	11240	11245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_011889	CCG	2	6	11275	11280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_011889	GC	3	6	11342	11347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
263	NC_011889	CCTG	2	8	11380	11387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
264	NC_011889	GGC	2	6	11517	11522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915113
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270	NC_011889	AGA	2	6	11982	11987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915113
271	NC_011889	CGAT	2	8	11991	11998	25 %	25 %	25 %	25 %	220915113
272	NC_011889	GC	3	6	12016	12021	0 %	0 %	50 %	50 %	220915113
273	NC_011889	GTG	2	6	12027	12032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915113
274	NC_011889	C	6	6	12110	12115	0 %	0 %	0 %	100 %	220915114
275	NC_011889	CGC	2	6	12139	12144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
276	NC_011889	GA	3	6	12165	12170	50 %	0 %	50 %	0 %	220915114
277	NC_011889	GAA	2	6	12182	12187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915114
278	NC_011889	TCGCT	2	10	12204	12213	0 %	40 %	20 %	40 %	220915114
279	NC_011889	CGC	2	6	12274	12279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
280	NC_011889	GCA	2	6	12310	12315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915114
281	NC_011889	CCG	2	6	12321	12326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
282	NC_011889	GTA	2	6	12382	12387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915114
283	NC_011889	GAC	2	6	12410	12415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915114
284	NC_011889	GGA	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915114
285	NC_011889	GCC	2	6	12452	12457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
286	NC_011889	GGC	2	6	12481	12486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915114
287	NC_011889	GC	3	6	12553	12558	0 %	0 %	50 %	50 %	220915114
288	NC_011889	CGAGGA	2	12	12559	12570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220915114
289	NC_011889	GC	3	6	12589	12594	0 %	0 %	50 %	50 %	220915114

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.